A baktériumok transzformációját, gyakorlati molekuláris biológia

Kémiailag kompetens sejtekbe lehet transzformáltunk a ligációs keveréket nyers (és általában a DNS található, mérsékelten pufferolt sóoldat). A sejtek száma egy kémiailag illetékes csomagolás jelentősen kevesebb, mint elektrokompetensE, így az egész csomagolási lehet bevonatú csészénként.

Előállítása kompetens sejtek.

  • Photo (-70 ° C) diszpergáljuk a baktériumok szelektív közegre csésze;
  • 37 o C-növekedni, ON;
  • Számos telepet (10-12) átmérőjű 2-3 mm helyezünk egy lombikba 40 ml SOB 0.5-1.0L.
  • intenzíven rázás (200-300rpm)

    * Vagy 37 ° C - átlagos szintű szakértelem, de az idő rövid,
    * Akár 18 o C (átrendeződik egy hideg szobában rázógépen) - kompetencia fenti, de a növekedés ideje - több nap;

    Minden további átalakításokra került sor a hideg.

  • 50 ml CF-cső fel 30ml kultúra;
  • 0 o C, 10-15 „;
  • DF 2-3krpm 4 o C, 10”, a felülúszót leszívatjuk;
  • ZF 2-3krpm 4 o C, 20 '', óvatosan távolítsuk el maradék folyadék;
  • szuszpendálunk 10 ml TB;
  • 0 o C, 10-15 „;
  • ismételje igénypont 7, 8;
  • újra szuszpendáltuk 2 ml TB;
  • + DMSO-ban, 3,5% (70μl);
  • 0 o C, 10-15 „;
  • ismételje p.14,15;
  • razalikvotit 100 yd be hűtött 2 ml menetes kupakkal;
  • folyékony nitrogénben lefagyasztjuk;
  • tárolás folyékony nitrogénben (jobb) vagy a -70 ° C-on
  • készített 100X Photo (0,5 jig / ml) friss oldat pDNS 5 ng / ml;
  • 0,5 M bMeEtOH jégben felengedtetünk, és egy alikvotot a sejtek;
  • hozzá egy aliquot kompetens sejtet:

    4 pl 0,5 bMeEtOH,
    2 pl (10 ng) pDNS;

  • 0 o C, 20-60 „;
  • 42 o C, 30 '', rázás nélkül;
  • egyszer jég, 2 ';
  • + 400 ul SOC;
  • szűk csavaros kupak, rázzuk vízszintesen egy bakteriális rázógépen 37 o C-on, 30 „;
  • koca 50 lambda egy csésze egy antibiotikum;
  • növelhető, ha "N" telepek, a kompetencia Nh10 = 6 [telepet / ug].
    1. hasonló „ellenőrzés”;
    2. Egy aliquot lehet venni az összeg a pDNS o C (titer nem változik). A következő napon, kiszámítja a sejtek száma a vetés, koca.
    10%.
  • Átalakítás frekvencia állandó a 10 ng pDNS / 100 ni sejtek, majd nagyon gyorsan csökken.
  • Telítettség a területen 100-200ng / 100 ni sejtek.
  • > 25 ng / 100 jil sejtek - egy érzékelhető gyakorisága kettős transzformánsok jelennek meg.
  • Abban az esetben, nagyszámú egyszerű transzformációk (például klónozó plazmidok) működését jelentősen lehet gyorsítani, ha (i) az átalakulás, hogy egy kis mennyiségű sejt ( 20 ul), (II) kitisztítottuk után azonnal hősokk nélkül ( „ébredés”).
  • Azt olvastam és hallottam egy teljesen más nézeteket követelmények a minőségi DMSO. Ezért minden esetben használjuk a „Sigma, # D2650”, csomagolt argonatmoszférában (alikvot ampullákban 5 vagy 10 ml). Fasuem egyszer, és tárolja a csomagolás -70 ° C-on
  • A fő előnye a kémiailag kompetens sejtek előzetes elektrokompetens:
    1. Kémiailag kompetens sejtekbe lehet transzformáltunk a ligációs keveréket nyers (és általában a DNS található, mérsékelten pufferolt sóoldat). Abban az esetben, elektrokompetens - DNS tisztítani kell, mivel (I) túl magas sókoncentráció okozhat egy szikra kisülési a sejtben (ii) ha a héj elektrotransformatsii E. coli lyukak jelennek meg, képesek áthatolni az alkalmazott enzim ligáláshoz.
    2. A sejtek számát az elektro-csomagolás lényegesen több, mint a kémiailag kompetens, ezért ne próbálja vetni egy csésze túl nagy részesedést csomagolás. Ez tele van aljnövényzet (Advent a műholdas telepek), valamint csökkent a kompetencia.
  • Növekedés 37 o C-on vezet éles (akut maximum) függően hatáskörébe a sejtsűrűség (A600 = 0,45 DH10B). A 18 o C-kal magasabb kompetencia elérni egy széles A600 = 0,35-0,70.
  • Kommunikáció sejtkoncentráció egy optikai sűrűség: OD550 = C [sejt / ml] * augusztus 10 / K.
  • PIPES részeként TB lehet helyettesíteni HEPES vagy BES. Ez csak akkor vezet egy kis csökkenés hatáskörébe tartozik. Transzformációs hatékonyság gyakorlatilag állandó tartományban pH 5,6-7,0, azonban, pH> 7,0 MnCI2 kicsapódik.
  • DMSO nagy koncentrációban mérgező a baktériumok (Ez lehetővé teszi nem törődnek annak sterilitását), ezért hozzáadjuk a sejtekhez a két fázisban. Sőt, jobb hozzá oly módon, hogy elkerüljük olyan területek „magas koncentráció” (de tipchika vége belemerül a sejtszuszpenzió nem lehet - DMSO megfagy és eltömítheti típus). Vagy csepegtetünk állandó keverés közben, vagy a fel (ahol fagyasztva DMSO) hűtött cső fala, amelyből öblítse, keverés cső.
  • A csövet kell műanyag, a használata az üveg csövek csökkentheti a hatékonyságot körülbelül 10-szer (feltehetően azért, mert DNS adszorpciója üveg).
  • Fagyasztás folyékony nitrogénnel (hideg sokk) javítja kompetencia 4-5 alkalommal.
  • Effect plazmid mérete a transzformációs hatékonyság: moláris frekvencia lényegében állandó méretek
  • Heat shock: A hőmérséklet lehet tartományban 40-50 o C
  • Leírták, hogy ha a hősokk cserélje ki a „cseppfolyós nitrogénben megfagyasztjuk, (1„), a felolvasztás (maximum NT)”, a növekedés kompetencia

    Kapcsolódó cikkek