Peptid csoport kommunikáció - Referencia vegyész 21
Kémia és Vegyészmérnöki
Monomer egységeket. ahonnan proteinek épülnek, ez egy 20-aminosav. Ezek a kis molekulák vannak felruházva általános tulajdonsága, hogy az összes molekula polimerizálódni képesek tartalmaznak legalább két különböző kémiai csoportokat, amely képes reagálni egymással kovalens kötést képez. Ilyen aminocsoportok amino (-YNg) és karboxilcsoport (-COOH), és a kötés, amely által meghatározott kialakulása protein polimer. Ez egy peptid (amid) kötést. peptidkötés kialakítására lehet elképzelni, mint az eliminációs származó vízmolekulák egyesítésével -COOH és -NH2-gpypp [egyenlet (2-7)]. A vizes közegben a reakció egyensúlyi, az ilyen típusú irányába van eltolva, a kialakulását a szabad aminosavak helyett a peptid. Ezért, peptid-szintézis (például in vivo. És a laboratóriumban) végezzük közvetve, és nem korlátozódik az egyszerű víz eliminálása. [C.80]
Az eredmények szerint az X-ray vizsgálatok állítottak atomközi távolságokat és szögeket a jellemző peptidet csoportok. Ezen adatok alapján a standard beállításokat feltételezték atomok távolságokat és szögeket peptid csoportokat. Különböző vegyületek ezen eltérésekkel a standard értékeket belül néhány század egy angström frakciókban és kötéstávolságok tartományban 3-4 ° a nyújtás szögek. Ezek az eltérések magyarázata feszültségek megjelenő különböző részei a szerkezet rec kialakulását sűrű a molekulák a kristályok. Szabványos paraméterek peptid csoportokat ábrán mutatjuk be. 11 Amint azt a tanulmány számos vegyület. hosszúságú peptid kötés -C-N- tartományok mintegy 0,02-0,03 átlagérték 1,35 A. Ez a távolság nem egyezik meg a hossza [c.537]
De az első néhány perc dolgozó modell nem hozott számunkra örömöt. Bár atomok csak fél tucat, aztán kiesett az ügyetlen bilincsek, ami kellett volna tartani őket a megfelelő távolságban egymástól. Rosszabb fejlődött kellemetlen benyomást kelti, hogy a kötésszöget legfontosabb atomok nem engedelmeskednek semmilyen szabályt. Semmi jó nem ígért. Pauling létre a szerkezet a-hélix, jól tudván, hogy a peptid csoportok lapos. És akkor, mi bosszant, mint kiderült, hogy a foszfodiészter kötések. amelyek összekötik a szomszédos nukleotid DNS szinte biztosan lehet nagyon különböző alakzatokat. Különben is, nem volt elég a kémiai intuíció. válassza ki egy konfigurációs, ami sokkal fényesebb az összes többi. [C.57]
Ezért, a C-N kötés a peptid-csoport hasonló a kettős, hogy hangsúlyozzák és hossza (0,132 nm) a rövidebb hosszúságú egyszeres kötés. Feltételezzük, hogy a hozzájárulást a ionos szerkezetet körülbelül 40%. Ez vezet a fontos következtetés csoport C-N lapos és kell, két formában [c.176]
Diszulfid-kötés között keletkezik tartozó különböző láncok cisztein maradékok. A kénatomjai -SH csoportok a két aminosav-maradékai oxidatív hasítást hidrogénatom kötve ugyanolyan módon, mint azok csatlakozott a molekulában cisztin (p. 287). A hidrogénkötések által alkotott hidrogénatom (p. 106), a nitrogén és az oxigén atomok peptid csoportokat. Például [c.292]