Sci segítségével játszani Bashmakova • hit • tudomány hírek „elemek» • molekuláris biológia

„Hajtás” egy screenshot a játék. A nyilak azt mutatják:
A tulajdonságok a fehérje láncok: 1 - túl sűrűn állnak alkilcsoport; 2 - hidrogén kötés; 3 - hidrofób aminosav-oldallánc; mert nem védett (azaz nem elrejtve a fehérjemolekula), rajta „lóg” sárga cseppek; 4 - hidrofil aminosavmaradék; 5 - egy szegmense a fehérje „gerinc” (azaz, a fő lánc), amelynek megnövekedett energia, és ezért egy dedikált piros.
Eszközök lejátszó: 6 - „gumi”, amelyben a játékosok ellenőrzik az automatizált eszközök; 7 - „befagyasztása” fehérje „gerinc”, hogy megőrizzék a helyszínen változatlan változásokat más régióiban a fehérjét.
A játék felület: 8 - egy panel, mely az aktuális állapotát a játékos, beleértve a több szerzett pont; 9 - egy listát a legjobb egyetlen játékos, és a legjobb csapatok; 10 - a központ további eszközöket és lehetőségeket; 11 - chat kommunikálni a többi játékossal; 12 - „szakácskönyv” az új automatikus eszközöket, vagy a „receptek”, hogy működjön együtt a fehérje.

Nemrégiben egy csapat amerikai kutatók létrehozott egy hasznos on-line játék az úgynevezett „szeres» (Foldit - «Gyűjtés it"). Játszani, akkor segíthet a tudomány fejlődése, amelyek részt vehetnek a nem csak a diplomások, hanem a közönséges halandók. Ha felkérik, hogy reshitodnu legfontosabb, kiterjedt és unalmas feladatokat a biológia - meghatározni a helyes konformáció a fehérje az elsődleges szerkezete. De a játék ellen, unalom eltűnt. A képernyőn - sokszínű lánc, amely meghatározza bizonyos szabályok szerint. A helyes döntés pontokkal egészül ki, minden játékosnak megvan a saját értékelése. Ön is csatlakozhat csoportok és a problémák megoldása együtt - és ugyanakkor előrelépés biológia.

Ismeretes, hogy a protein elsődleges, „sodratlan” állapotban - egyszerűen egy lineáris láncú aminosavak. Az egyes aminosav-ebben a láncban bizonyos tulajdonságai - ez lehet hidrofil vagy hidrofób, pozitív vagy negatív töltésű, és így tovább.

Attól függően, hogy az őket birtokló aminosavak kezdődik, hogy kölcsönhatásba lépnek. Hidrofób aminosav tapadnak egymáshoz, és elrejteni belsejében egy fehérjemolekula, ahol nincs víz. Hidrofil aminosavak, mint ölt, mert a víz mennyisége a citoplazmában közülük nem egy kicsit ijesztő. Ellentétes töltésű aminosavak vonzódnak, és ugyanolyan töltésű - taszítják. Ahol lehetséges, aminosavak között, amelyek diszulfid-hidak és a hidrogén kötések.

Ennek eredményeként ezek a kölcsönhatások, fehérje lánc kezd meghajlítani, és hajtsa, míg végül eléri ilyen konformációban, amely „egyetért” mindenkor az aminosavak. Ebben az állapotban, a belső energiája egy fehérje molekula minimális.

Úgy tűnik, hogy semmi sem könnyebb, mint annak kiszámítására, milyen a fehérje konformációjára akarat alapján az aminosav-szekvencia. De ott volt! Az egyetlen lehetséges konformáció létezik, csak a nagyon rövid és egyszerű fehérjéket. A fehérje hosszabb, annál különböző konformáció is eltarthat, de csak egyikük helyes. És ennek eredményeként egy szegény tudós egyedül marad egy nagyon hosszú aminosav szekvenciája lehet, hogy tíz különböző módon.

Persze, van egy különleges program az úgynevezett „Rosetta”. amely kiszámítja a megfelelő konformációjának a fehérje alapuló aminosav-szekvencia (vagy alternatív módon, kiválasztja az optimális szekvencia alatt a szerkezet mesterségesen szintetizált fehérje). De - sajnos! - és a „Rosetta” hibázik. Úgy tűnik, a számítógép gyakran egyszerűen nem tudja kiszámítani a megfelelő fehérje szerkezetét, mert az emberi térbeli gondolkodás és az intuíció szükség.

Egy nagy csoport amerikai tudósok úgy döntött, hogy megközelíteni a problémát a másik oldalon, és kapcsolja unalmas és csak neohvatnuyu feladatot (fehérjék - több százezer) egy érdekes játék.

A puzzle, ahol először meg kell „szétcsavar” a fehérje lánc, majd hajtsa helyesen. A kép a cikk tárgyalja a természet

játékszabályok egyszerűek: adott aminosav szekvenciája, és a játékos csavarok és forgatja a amíg ő nem fog az optimális háromdimenziós szerkezetét. Ahhoz, hogy adjon meg egy újonc a swing a dolgok, több képzési fejtörőket, rejtvényeket, megoldásában, hogy meg tudja érteni a játék alapjait. Fen aktivitásának résztvevők fejlesztők által létrehozott egy rangsor a legjobb játékosok (és mint kiderült, az egyik legjobb játékos hivatásszerűen foglalkozó biokémia). Ezen túlmenően, hogy megoldja a puzzle, akkor nem csak egyedül, hanem az egész csapatnak.

Mint kiderült, az emberek gyakran megbirkózni egy puzzle javasolt jobb, mint a „Rosetta” - különösen, ha annak érdekében, hogy elérjék a megfelelő konformáció kezdetben kissé megfejteni a fehérje lánc, azzal az eredménnyel, hogy az energia megnő. A program ilyen esetekben leállt, és adta ki a rossz döntés, mert „szerzett”, amely növeli az energia - valami nem kívánatos. Ahhoz azonban, hogy az emberek nem volt probléma, mert tudták, hogy miután forgassa a kívánt módon, hogy az energia ismét csökken. Ezen kívül minden ember alkalmazott egyedülálló taktikát, hogy megfeleljen a kihívásoknak, és a program minden alkalommal járt ugyanígy.

Vak vizsgálat azt mutatta, hogy a tíz javasolt rejtvények emberek megbirkózott a feladattal jobb, mint a „Rosetta” öt esetben, két esetben nyerte a számítógépet, és három esetben lehet nevezni a döntetlen. A fejlesztők úgy vélik, hogy az ideális megoldás az lenne, hogy összekapcsolják a „szeres” és „Rosetta”, hogy az emberek nem kell bajlódni az eredeti szóló a fehérje lánc, amely lehet tenni egy jó számítógép, és kap munkát csak akkor, ha az emberi szem szükség további protein összecsukható.

Játékwebhely: fold.it/portal. Ahhoz, hogy indítsa el a játékot, akkor regisztrálnia kell, és tedd egy speciális számítógépes program. Ahhoz, hogy megtanulják, hogyan kell csinálni mindent, ami írva van.

és nem tudom megnyitni a programot letöltés után, bár azt mondja, hogy a program is alkalmas Vista
((

Heard Amerikában várhatóan a vírus molekuláris vagy atomi szinten. Megkérdezték pont konkrét koordináták körül egy atom vagy molekula és a számítási voltak változtatni a térerő, amely változik az mozgásával atomok vagy valahogy másképp? Olvasok egy táblázat, amely alapján a kísérletek elektronvoltos a kölcsönhatás az atomok és egyszerű molekulák. A sok információ található himik.ru de nem minden próbálja meg zhalko.Igru. Valószínûleg csak tervezték, hogy kezelje a kisebb méretű és önjáró más atomok és molekulák lehet még jobb gyűjtő atom atom. Programku lehet gyűjteni shkolnikov.Da csavarja a kar a molekula energia küszöbértékek a kötési energiája törés és mn.dr.V „ev” vagy olvasott egy kísérlet, mint valami világossá válik. Talán a tanulók között vannak olyanok, hogy az eredmények néhány kísérlet jön fel sok új kísérletek. Mi lehet mindenki teoretikusok.

És hol van az energia bomoljon? Ez azt hiszik? Ha felfeslése - a tényleges szakaszában a folyamat, akkor ez megköveteli a forrása a kezdeményező ( „Match”), és a láncreakciót. Van egy igazi rendszer használatának lehetőségét az energia egy molekula összecsavarodó többiek? Azaz, hogy van-e egy olyan mechanizmus megvalósítása egy láncreakció? És hogy van-e valós rendszer, a mechanizmus a „gyújtás” a reakció és az energiát is? Ha a válasz legalább egy ilyen kérdés nincs, akkor a molekula keletkezik nem optimális, és egy lokális minimum. Ha minden, marad még egy kérdés. A molekulák nem úsznak az ideális reaktorban, hanem egy valós környezetben. Mi az energia hozama a reakció? Ez magában foglalja a veszteség? Ha nem, akkor megkapjuk az optimális keverék és az optimális forma. Így a feladat hozzáteszi még egy tényező. Vagy nyers adatok nifiga nem felel meg az eredeti konfiguráció valós molekulák (például, azokat közvetlenül szintetizálható a legjobb formában)? Akkor ezek a kérdések nem kapcsolódnak a problémát. És lehetséges, hogy tanulmányozza az alakja fehérjemolekulák kísérletileg?