Taxonómia, osztályozás és a vírusok nómenklatúrája
A vírusok osztályozása összetett és jelenleg nem teljes. K. Linnaeus vírusokra vonatkozó osztályozási elvei elfogadhatatlanok voltak. 1971 óta a világ hivatalosan alkalmazott univerzális vírus osztályozási rendszer alapján polythetic hierarchikus elv, kiterjesztett Adanson M. (1727-1806 gg.) - francia botanikus, egyik alapítója a természeti rendszer a növények és a matematikai eszköztudás a biológiában. Ezen elv szerint figyelembe veszi a maximális számú morfológiai, fiziológiai, genetikai és egyéb jelei vírusok (legalább 60), amelyek mindegyike egy bizonyos fokú jelentőséggel bír. Az adanison besorolás hátránya nem a munkafüzet, hanem a sok vírusról szóló teljes információ hiánya.
vírusok megrendelések - a csoport vírus családok közös jellemzője eltér a további megrendelések és a családokat. Az utótagokkal jelölt nevek - virales. Jelenleg hozzárendelt 3. érdekében vírusok :. Mononegavirales (vírusokat tartalmazó egyszálú negatív RNS), Caudovirales ( „farkú” bakteriofágok), Nidoviralesek (lat nido - fészek vírusok szubgenomi RNS splicing átírt replikáció során formájában fészkek ), amelyek közül csak az elsőt az MKTV hagyta jóvá.
A Mononegavirales sorrendje a családok: Paramyxoviridae, Rhabdoviridae és Filoviridae.
A víruscsaládok víruscsoportok olyan közös tulajdonságokkal rendelkeznek, amelyek eltérnek a más családoktól származó vírusoktól. A vírussal jelölt névvel jelölt. A család olyan kifejezés, amely az idő próbáját állította és nem változik meg. Ez a taxonómiai hierarchia szintje stabil sarokköve. Sok víruscsalád világosan különbözteti meg a virion szerkezetét, a genom szerkezetét és a replikáció útját, amely meghatározza a filogenetikai függetlenséget vagy a nagy filogenetikus különálló struktúrát.
Az alcsaládokat 4 családban különböztetik meg: Poxviridae, Herpesviridae, Parvoviridae, Paramyxoviridae - bonyolultabb taxon hierarchiához. Az utótag -virinae használatos.
A víruscsalád leírása az M. Adanson osztályozási rendszere szerint (az MKTV irányelvei a családok leírásához):
A virion tulajdonságai. 1. virion morfológiája (méret, alak, jelenlétében vagy távollétében, és superkapsida peplomerov, szimmetria és kapszid struktúra). 2. A fizikai tulajdonságok a virion (molekulatömeg, sűrűség, szedimentációs koefficiens, pH-stabilitás, hőmérséklet-stabilitás, kationok (magnézium, és mangán) a stabilitás, az oldószerekkel szembeni ellenállás, mosószerek és az intézkedés a sugárzó energia). 3. Tulajdonságok a genom (egy nukleinsav típusú, a szálak száma, lineáris vagy cirkuláris polaritás, a szegmensek száma, a méret a genom vagy a szegmensek, a jelenléte vagy hiánya egy sapkát az 5 „végen, a jelenléte vagy hiánya az 5” végén kovalensen kapcsolódó polipeptidet, a jelenléte vagy hiánya a poli (A) szekvencia 3-terminálisán vagy más specifikus szekvencia, nukleotidszekvencia). 4. A fehérjék tulajdonságai (szám, méret, funkcionális aktivitás, aminosavszekvencia). 5. Lipidek (jelenlét vagy hiány, természet). 6. Szénhidrátok (jelenlét vagy hiány, természet).
A genom szervezése és a replikáció. 1. A genom szervezése. 2. A nukleinsavak replikációjának módszere. 3. A transzkripció jellemzői. 4. A fordítási és a poszttranszlációs feldolgozás jellemzői. 5. A virion fehérjék felhalmozódásának helye, szerelési hely, felszabadulási hely. 6. Cytopatológia.
Antigén tulajdonságok. 1. Szerológiai jellemzők. 2. Epitópok.
Biológiai tulajdonságok. 1. Természetes és kísérleti házigazdák köre. 2. Pathogenitás, összefüggés a betegségekkel. 3. Szöveti tropizmus, patológia, hisztopatológia. 4. Az átvitel módja a természetben. 5. Vektoros kapcsolatok. 6. Földrajzi elterjedés.
A vírusok nemzedéke olyan fajok egy csoportja, amelyek közös tulajdonságai eltérnek a többi nemzetségétől. Jelölve az utótag -virus. Ez a hierarchikus szint is stabil. A születések megteremtésének kritériumai különböző családokban különböznek: az összes kisebb genetikai, szerkezeti és egyéb jellemzőt új nemzetségek létrehozására használják. Az alap egy közös filogenetikai eredet (mint a családok esetében), de ez nem a jövőre vonatkozó állítás.
Az MKTV specifikus tulajdonságokat fejleszt ki a taxonban lévő fajok számára. Nyilvánvaló, hogy a "faj" kifejezést a "vírus" kifejezéshez hasonlóan kell meghatároznia - bár egyes esetekben a "vírus" kifejezést jobban kombinálják egy alfajal, törzzsel vagy akár változattal. Mivel a "vírus" különböző családokban van definiálva, a fajokat különböző módon kell meghatározni, néhány esetben a genom tulajdonságaira, más esetekben a strukturális, fizikai-kémiai vagy szerológiai tulajdonságokra. Egyes vírusokat fajként határoztak meg: poliovírus I, Newcastle-betegség vírus. Ezek a példák azonban nem tükrözik annak nehézségét, hogy a vírust fajnak, alfajnak, törzsnek vagy változatnak kell-e tekinteni.
A tartomány a vírusok szerint egy univerzális rendszer vírus besorolása határozza meg az alábbi szabályokat: 1) a végén a nemzetközi neve a faj a vírus legyen «... vírus», kedves - «... vírus» alcsalád - «... virinae», család - «... félék», annak érdekében, - "... virales"; 2) annak érdekében, család, alcsalád, nemzetség és faj is dőlt betűs (vagy aláhúzva) nagybetűvel; 3) a vírus fajnevének meg kell előznie a rend, család, alcsalád és nemzetség nevét; 4) a vírusok neve nem csökken.
Példák a fajok nevére:
1. A Mononegavirales sorrendje. család Rhabdoviridae. Lyssavirus nemzetség. típusú Rhabdovírus.
2. A Herpesviridae család. Alfaherpesvirinae alcsalád. futam Simplexvirus. típus - herpes simplex vírus 2.
Az emberre nézve patogén vírusok osztályozását a táblázat tartalmazza. 1.
Az emberekre patogén vírusok osztályozása