Három frakciót eukarióta DNS, azok kromoszóma lokalizáció és funkció
Vannak a következő frakciókat a eukarióta genomban.
1. Unique, azaz szekvencia-lennye képviselt egyetlen másolat vagy kevés példányban. Általános szabály, hogy cisztron - strukturális proteineket kódoló génekre.
2. Alacsony frekvenciás ismétlődő - sorozat, ismételt tucatszor.
3. A közepes vagy közepes frekvenciájú, ismétlődő - sorozat ismételt száz vagy több ezer alkalommal. Ezek közé a gének rRNS (az a személy, 200 haploid sor egér - 100, a macska - 1000 halak és virágos növények - több ezer), tRNS génjeit riboszomális fehérjék és hiszton fehérjék.
4. Magas frekvencia ismétlési szám eléri a 10 millió (a gén). DNS egerekből származó 70% áll egyedi szekvenciák, 20% - az alacsony frekvenciájú és közepes frekvenciájú ismétlések, 10% - a nagyfrekvenciás.
Ismétlések alkotnak úgynevezett családi, arra utal, hogy több szekvenciák, teljesen vagy nagymértékben homológ egymással.
Gyakran előfordul, hogy azért, mert a jelentős különbségek a nukleotid-összetétele a nagy DNS ismétlődés, és a fennmaradó szárak per-által alkotott centrifugálással sűrűséggradiens a cézium-klorid-Ness úgynevezett műholdas csúcsokból, amelyek magasabb vagy alacsonyabb lebegési sűrűségű, mint a többi DNS-t. Ez a frakció előre genom a kis- (10 ... 15) a számú gyűjtemények rövid (5 ... 12 bp) megismétli képező kiterjesztett blokkokat. A csoporton belüli blokkok különböző családok ismétlést lehet szőve egymással, úgy, hogy a szatellit-DNS olyan, mintha patchwork szerkezetét. A hibridizációt magas frakciói DNS-szekvenciák kormányzati közvetlen kromoszómán készítmények lehetséges annak megállapítása, hogy ez a frakció a genom lokalizált régiókban konstitutív heterokromatin, többnyire centromer és telomer. Vissza a 30-as években kimutatták, hogy genetikailag ezek a területek közömbös, azaz a. E. Ne géneket tartalmaznak. Sőt, olyan kicsi utáni szekvenciák, szatellit-DNS alkatrészeket nem kódolnak semmi más, mint oligopeptidekből. Sőt, heterokromatikus régiók nem íródik át. Így, abban az esetben a nagy DNS-szekvencia észlelése, és a személyazonosságát a molekuláris szervezet genetikai tulajdonságainak eukarióta kromoszomális DNS. Meg kell jegyezni, hogy a frakció a túlnyomó többsége fajok kevesebb, mint 10% a genom. Rokon fajok, mint például egér és patkány egyáltalán magas WIDE különböző szekvenciák patkány azok nukleotid-összetétel nem különbözik a mögöttes DNS, míg az egér genom tartalmaz egy megkülönböztethető AT-gazdag Satel-lit. Ez azt jelenti, hogy nagy gyakorisággal képes DNS gyors változás során speciációs.
A fennmaradó 90% a genom eukarióták, ez euhromaticheskaya része, elvére épül az interleaving (interspersii) az egyedi és ismétlődő szekvenciákat. Hagyományosan két fő típusa interspersii, félig nevek, akik befejezték az e fajok, mint ahogy azokat le először: interspersiya típus „ksenopus” (Keresés felesége Xenopusban Xenopus laevis) és a „Drosophila” típusú (le először a gyümölcslégy D. melanogaster). Körülbelül 50% genomjának Xenopus laevis egyedi szekvencia a 800 ... 1200 bp váltakoztak megismételjük átlagos mérete 300 bp A maradék genom a „ksenopus” távolság a szomszédos ismétlődések jelentősen haladja meg az 1 ... 2 bp A genom szerkezete a „ksenopus” széles körben elterjedt, különösen az Ms-votnyh. Az emlősök és emberek is ebbe a típusú genomszerveződésének. A különlegessége a humán genom és más főemlősök teszik interspersnye vysokocha-ismétlési frekvenciájú körülbelül 300 bp Embernél ezek ismétlődés tartalmaz egy helyén kell vágni restrik-TION enzim Alu I. A számú Alu-szerű ismétlődés a humán genomban eléri az 5 × 10 5, és egyesek szerint még június 10.
Alu-szerű szekvenciák a főemlős-lyayut reprezentációk részleges duplikáció (duplájára) a B1-szekvencia a genom a rágcsáló első leírt Georgiev, G. P. és munkatársai.
D. melanogaster paraméterek interspersii meredeken-fajok különböznek a típusú genom „ksenopus”: repeat-schiesya szekvenciája 5600 bp alternatív egyedi, a hossza, amely nem kevesebb, mint 13.000 bp
Érdekes megjegyezni, hogy a házilégy gén van elrendezve egy „ksenopus”. Ez a tény egyértelműen jelzi, hogy az evolúció során egy nagyon gyors átalakítása jellegű szekvenciák a szekvencia és euhromaticheskoy részei a genom. Baromfi paraméterei Interszegmens-Perzsia foglalnak köztes helyzetben a fajta „ksenopus” és a típus „gyümölcslégy”. Amint az eredmények mutatják, Tata vizsgálatok az elmúlt években, számos faj az állatok és növények a szervezet a genom nem lehet szigorúan titkos, mint az egyik vagy a másik típus. Például, a genomjában MLE-kopitayuschih Meet hosszú ismétléseket - néhány ezer bázispár genomjában a liliom, hogy 90% a DNS leírható ismétlődő szekvencia-kar. Például, a genom nem tartalmaz borsó uni-helyi-szekvenciák hossza nagyobb, mint 300 bp-
Egy másik jellemzője az ismétlődő sorozat-stey eukarióta genomokban - invertált ismétlődések vagy palindromes (lásd alább.). Az összeillesztési körülményeket szinte azonnal képeznek duplex struktúrát. Lényegében, palindromes pro-rész közbenső ismétlődések. Azonban néhány szükséges nagy WIDE euhromaticheskoy ismétlődések a genomban, mint a tagok a Alu-családok találkozhatnak szó szerint és a fordított helyzetben. Valamikor Inver ted ismétli beékelődött más nyomon képpen.